Plusieurs laboratoires Francais participent, soit au programme de construction, soit au programme de recherche entrepris au Jefferson Lab, soit au deux. Le CEA, et des unités CNRS de l'in2p3 de Clermont-Ferrand, Orsay, et de Grenoble se sont deja impliqués et plusieurs étudiants ont réalisé ou vont réaliser des thèses francaises sur des expériences au laboratoire.
L'utilisation des facilités expérimentales du Jefferson Lab est soumise a l'approbation d'un comité de scientifiques chargé de décider de l'intérêt scientifique des diverses propositions et d'attribuer le temps de faisceau, limité, pour les accomplir.
Aucune entreprise française ne collabore actuellement avec le laboratoire sur le développement de nouvelles techniques. Les possibilités de coopération sont pourtant importantes sur ces techniques de pointe.